故事围绕着两位表面上看来没有共同点也互不了解对方存在的年轻女性展开玛德拉丝是在陷入内战的卡萨索尼卡王国里一位对自己过去没有印象的传奇的雇佣兵和暗杀特务另一位女主角是玛格丽特巴顿她是宁静的欧洲国家那芙列斯一个富裕贵族家庭的唯一继承人在故事开篇的12年前玛格丽特和她的母亲乘坐的飞机在卡萨索尼卡坠毁那次事件之后飞机上的乘客以及担任救援人员指挥工作的玛格丽特的父亲一直行踪不明但是玛格丽特独自一人回到了那芙列斯可是已失去了记忆她唯一能回想起的只有玛德拉丝这一个词然而这条线索将两位少女联系在了一起自从强大的犯罪集团安纺的神秘的幕后主使人显示出对她们两人的兴趣她们开始对安纺展开独立的调查MADLAX作为BEETRAIN较早之前的作品NOIR的精神续作与魔女猎人三者构成美少女枪战三部曲MADLAX的制作开始于2002年但直到黑田洋介加入这个项目才确立其最终形式评论家们在指出MADLAX和NOIR之间的相似之处的同时也承认它们之间的不同点比如后者的剧情更为紧凑并且和以现实主义为主的NOIR相比MADLAX添加超自然的因素对于这些因素